Nació en Lima el 15 de febrero de 1947. Es bachiller en Ciencias e Ingeniero Industrial por la Universidad Nacional de Ingeniería (UNI). Además tiene un doctorado en Economía de la Universidad de Grenoble (Francia) y un diplomado en economía matemática del Centro de Estudios de Programación Económica de París.

Se ha desempeñado como profesor principal de la UNI desde 1974. También ha sido profesor del postgrado en Ciencias Sociales de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos (UNMSM), profesor invitado de la Universidad de Texas, Estados Unidos, conferencista en ILAS y en la Escuela Práctica de Altos Estudios de París.

En 1983 y 1986 García Núñez fue regidor metropolitano de Lima por Izquierda Unida durante la gestión del fallecido ex alcalde Alfonso Barrantes. Asimismo, fue decano Nacional del Colegio de Ingenieros del Perú de 1986 a 1987.

Ha sido consultor y evaluador del Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia (UNICEF) de 1999 al 2001. En setiembre del 2001 es designado Director del Banco Central de Reserva del Perú (BCR), cargo al que renunció en el mes de mayo del 2006.

También fue representante ante el directorio del Fondo Latinoamericano de Reservas, las actividades y misiones del Fondo Monetario Internacional (FMI), el Banco de Pagos Internacionales (BIS), Centro de Estudios Monetarios de América Latina (CEMLA), la Comisión Económica para América Latina (CEPAL). Es autor del libro “Perú: la Visión de los Excluidos”, coautor de “Circuitos productivos de la pequeña producción, el caso de Villa El Salvador”.

En diciembre del 2005 acepta acompañar al candidato presidencial Ollanta Humala como candidato a la primera vicepresidencia de la República por Unión por el Perú (UPP), siendo derrotados por Alan García en la segunda vuelta el 4 de junio.

Posteriormente, el 30 de agosto del 2006, García Núñez fue presentado por Humala como el candidato del Partido Nacionalista Peruano (PNP) para la Alcaldía de Lima, en las elecciones regionales y municipales de este 19 de noviembre.